20.02.2020-года состоялось очередной семинар Института Физических Проблем.
На семинаре выступила главный научный сотрудник отдела “Биофизика” Лариса Исмаилова с докладом “Структурная организация тетрапептидных молекул глипролинов” .
На семинаре докладчик рассказала о пространственном строении и конформационных свойств тетрапептидных молекул глипролинов: природной молекулы Gly-Pro-Gly-Pro и ее аналогов Arg-Pro-Gly-Pro, Leu-Pro-Gly-Pro , Val-Pro-Gly-Pro и Phe-Pro-Gly-Pro, а также природной молекулы Pro-Gly-Pro-Gly ее аналогов Pro-Gly-Pro-Argç Pro-Gly-Pro-Leu, Pro-Gly-Pro-Val и Pro-Gly-Pro-Phe которые были исследованы с помощью метода теоретического конформационного анализа. Эти молекулы участвуют в жизненно важных процессах и используются в качестве лекарственных препаратов.
Потенциальная энергия каждой молекулы выбиралась как сумма невалентных, электростатических, торсионных взаимодействий и энергии водородных связей. Найдены низкоэнергетические конформации для каждой молекулы, значения двугранных углов основной и боковых цепей, оценена энергия внутри - и межостаточных взаимодействий. Расчет показал, что низкоэнергетическими для тетрапептидных молекул являются свернутые и полусвернутые формы основной цепи. Такие формы сближает участки основной цепи и боковые цепи аминокислот, входящих в эти молекулы, и приводит к их эффективным взаимодействиям.
